2009年10月,台灣大幅放寬美國牛肉進口部位,面對外界痛批政府高層「喪權辱國」之下,時任衛生署長的楊志良出面解釋,美國賣東西給台灣卻得受委屈,經過這麼長時間的諮商談判,「美國人自己吃老牛,我們吃嫩牛;美國要賣給我們,我們還要挑肥揀瘦。」
2010年1月13日,立法院審議之開車騎機車及走路禁菸法案,時任衛生署長楊志良表示「抽菸是個人的自由,在戶外走路抽菸是民眾的選擇,如果連這個空間都要剝奪,會讓人誤會好像要趕盡殺絕」。
2011年7月,出書《拚公義,沒有好走的路》,但書中卻稱沒醫德為獸醫。引起獸醫公會不滿,要求楊志良道歉,並下架修改書籍內容,否則提告;但楊志良拒絕道歉,並挑釁「要告就去告。不過在律師陳長文斡旋之後,楊志良於同年7月25日道歉。同年,楊志良於第六十三屆世界衛生大會行前記者會上透露「希望台灣能開放中國當地醫院納入台灣健保特約」。
2014年11月4日縣市長大選前,楊志良投書蘋果日報,表示要給連勝文良心的建議「反正勝選無望,留點骨氣,叫這些死要錢的叔叔伯伯滾回去吧」。同年7月10日,投稿蘋果日報「健保虧待醫界?醫界虧待健保?」,文中表示「以2013年為例,西醫基層健保合約診所共有10,120家,醫師14,684名,給付總額是 1,658.6億。亦即平均支付每一診所每月超過136萬,或說每名醫師每月94萬。」然而文中引用錯誤數據,引發醫界質疑,實際上1,658.6億是西醫基層、牙醫和中醫三大總額的給付合計,而且是點數而非元,用此合計除以西醫基層診所數及醫師數,所得結果當然是錯誤,實際上該年給付西醫基層總金額為959.8億,算出來給付平均每診所每月應為79萬元,每醫師每月應為54萬元。
2015年4月22日,楊志良對外宣布參選中國國民黨2016總統大選提名初選,後由洪秀柱出線。
2020年8月10日,楊志良投書於Yahoo論壇【給美國衛生部長阿札爾的一封公開信】中譴責美國總統川普在新冠疫情防疫不力,呼籲正在訪台的美國衛生部部長阿札爾宣布辭職給予壓力,但言論內容及英文文法受到質疑。
2021年1月12日,楊志良於新聞面對面節目中針對不幸染疫的醫師及護理師發表評論,認為染疫醫護未在第一時間通報,「假如我是院長,第一件事情就是把他開除」。