1950年，以色列宣布耶路撒冷為首都，此後，以色列政府的所有部門——立法機關[85]、司法機關[86]和行政機關，包括總統府和總理府——均設在耶路撒冷市內[87]。當時耶路撒冷分為2部分，分別由以色列和約旦管理，只有西耶路撒冷作為以色列的首都。1967年六日戰爭後，以色列占領東耶路撒冷。

1980年7月30日，以色列國會通過法案（《基本法：以色列首都耶路撒冷》），宣布耶路撒冷（包括西耶路撒冷和東耶路撒冷）是以色列「永恆的與不可分割的首都」[88][88]，但並未得到國際承認。聯合國安理會478號決議（14票贊成，0票反對，美國1票棄權）宣布這項法律無效，並要求其成員國必須從該市撤出外交代表作為懲罰措施。但在478號決議之前，大部分大使館已設在特拉維夫。在耶路撒冷設立大使館的少數國家中，大部分按照決議，將大使館遷往特拉維夫。2006年8月16日和26日，最後2個在耶路撒冷市內設立大使館的聯合國成員國—哥斯大黎加和薩爾瓦多先後宣布將大使館遷往特拉維夫[89][90]。不過，在耶路撒冷郊外的Mevaseret Zion，設有巴拉圭和玻利維亞的大使館。耶路撒冷市內設有美國和義大利的總領事館[91]。

美國國會在1995年以絕大多數通過了耶路撒冷使館案（Jerusalem Embassy Act），其中參議院93票支持、5票反對，眾議院374票支持、37票反對，提議將美國駐以色列大使館從特拉維夫遷到耶路撒冷[92]。但是根據美國憲法，國會並無干預外交政策的權利，此項法案內容違憲。

在1967年六日戰爭中，以色列占領耶路撒冷東部，立刻開始將整個城市歸入以色列控制。它占領了6.4平方公里的原約旦的耶路撒冷和64平方公里的西岸並將這塊地方改名為「東耶路撒冷」。被占領地區的居民假如自願放棄他們的約旦國籍的話可以獲得以色列國籍，但大多數人沒有接受這個待遇。

1980年以色列國會制定《基本法：耶路撒冷—以色列的首都》，確定耶路撒冷是以色列「永遠的和不可分割的首都」[44]，而巴勒斯坦自治政府也宣布東耶路撒冷將成為未來巴勒斯坦國的首都[45][46]。