根據TVBS新聞臺在2007年的報導指出，平均1個月裡每隔10天便能夠看見電視臺訪問林杰樑的畫面。而對於記者的約訪他也很少表示拒絕，並且能夠耐心回答記者所提出的基本問題。同時他除了會自行轉化原本困難的名詞並且提供記者簡單的解釋[32]，亦會提供完善的資料供新聞媒體參考[12][18]。而雖然有時候會遭遇新聞媒體報導錯誤或者扭曲內容，然而林杰樑還是會盡可能幫助新聞記者取得有關資料。對此中華民國醫師公會全國聯合會祕書長蔡明忠也提到：「不管是瘦肉精美牛案、三聚氰胺毒奶粉事件、塑化劑添加物、毒澱粉等重大事件，還是動物肉品用藥、蔬果農藥殘留等例行抽驗，林杰樑幾乎無役不與。[11]」這般作為除了使林杰樑與新聞記者建立友好關係，也讓他成為媒體第一時間解答疑問的毒物專家[52]，而中華民國醫藥衛生記者聯誼會甚至還曾經讓他與柯文哲共同獲頒醫藥記者之友獎[32]。

不過在其提出有關汙染的統計數據時，有時候也會遭到跟預期結果不一的環保團體給予壓力。而雖然他時常受邀成為政府單位諮詢的專家學者，但由於多次在新聞媒體上批評行政院農業委員會和行政院衛生署等等政府機構的醫療政策、食品安全機制和潛在公共健康威脅等[40]，這使得使得一些新聞媒體形容他是不受官方歡迎的黑名單學者，甚至認為他因而被排除在美國牛肉跨部會技術諮詢小組專家之外[11]。而對此他也提到：「常常被當做絆腳石，覺得好累，但不把問題及真相說出來，無法安心……[45]」此外林杰樑也堅持不接受廠商的代言邀請，也只安排由非營利的公家機關所舉辦的衛生教育演講，藉此避免因為參與商業活動而使得往後評論受到影響。而擔任過行政院衛生署疾病管制局副局長的施文儀則表示不少醫師成名後會被政府或者廠商收買，但是「沒有人買得動林杰樑」[53]。