指揮中心即將於5月1日解散，總統蔡英文也於第1194天參與指揮中心終場記者會，她表示終於我們一起努力經過一波又一波的疫情挑戰，同步解編有很多感觸，今（27）日是她第十次到指揮中心，回顧防疫過程充滿挑戰與溫馨的故事；蔡英文也特別提及，疫情期間有小男孩因戴粉紅口罩被嘲笑，指揮中心官員戴上粉紅口罩破除霸凌。解編後，將繼續推動疫後經濟復甦。

蔡英文表示，每次來了解大家的因應作為，也謝謝大家的辛苦，深感言語無法表達深層的感謝，我們畢業的指揮官，指揮中心的夥伴，一線防疫人員真的都很辛苦，每天2點多準時收看的記者會，進超商前會掃的實名制，還有看到家人的喜悅，這都是一起走過的防疫歷程。

蔡英文表示，我也還記得有家長反映兒子因為戴粉紅色口罩被同學議論，指揮中心的叔伯們，應該是大哥大姐們，就在記者會上戴上粉紅色的口罩，以行為破解顏色的性別刻板印象，回顧防疫過程充滿了挑戰，也充滿了溫馨的故事，謝謝從中央到地方從政府到民間所有投入防疫的夥伴，大家相互扶持，凝聚了最大的防疫的力量。

蔡英文表示，我也要感謝全體國人配合政府的政策，團結防疫讓台灣在疫情中持續穩健的發展，指揮中心解編之後我們會由衛福部成立跨單位的防疫會報，持續進行防疫的整備應變工作，守護國人的健康，也會繼續推動疫後的經濟復甦，還有許多工作等著我們來完成，再次感謝所有夥伴的付出謝謝大家， 媒體朋友也辛苦了。