※ 本文為 cuteman0725 轉寄自 ptt.cc 更新時間: 2012-01-09 23:13:39
看板 EZsoft
作者 標題 [推薦] Cellprofiler-強大的科學影像分析軟體
時間 Fri Jan 6 09:44:22 2012
軟體名稱:
CellProfiler
軟體資訊:
英文/xp~Win7/Mac/Linux
軟體功能:
科學影像分析用,可以幫你算細胞,或是某個螢光染色的強度等等
軟體特色:
可分析像是 Arrayscan 掃出來的圖,能修改的細節相當多
可搭配 CellProfiler Analyst 作一些 Data 的分析與瀏覽
(CellProfiler Analyst 也是免費)
可搭配 CellProfiler Analyst 作一些 Data 的分析與瀏覽
(CellProfiler Analyst 也是免費)
官方網站:
http://www.cellprofiler.org/
下載連結:
CellProfiler:
http://www.cellprofiler.org/download.shtml
CellProfiler Analyst:
http://www.cellprofiler.org/downloadCPA.shtml
推薦原因:
可以批次處理一堆圖 (圖檔有命名原則就好)
重點是免費呀,同性質的付費軟體都要將近百萬上下
另外似乎可以搭配資料庫使用 (這個找時間再來研究 XD)
誰適合用:
需要科學影像分析的人
誰不適合用:
排斥英文,懶得花時間研究此軟體的人
使用感想:
只有讚而已
可以把你要的步驟 (包括影像的前處理) 全部寫在一個 pipline 裡
可針對特定的實驗寫特定的 pipline
網站上也有許多實例可以下載參考
本著作依據 Creative Commons 姓名標示-非商業性-相同方式分享 授權條款為授權
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◆ From: 140.109.235.155
推 :感覺就是個專業軟體XD1F 01/06 12:07
→ :跟ImageJ比起來如何? 借問一下是否可轉生物版?2F 01/06 15:37
→ :CellProfiler 比較偏向 high throughput 的實驗使用3F 01/06 16:19
※ vixen:轉錄至看板 Biology 01/06 16:25推 :感覺很帥氣的軟體4F 01/06 18:54
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※ 看板: P_qman 文章推薦值: 0 目前人氣: 0 累積人氣: 972
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