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※ 本文為 cuteman0725 轉寄自 ptt.cc 更新時間: 2012-01-09 23:13:39
看板 EZsoft
作者 jimmy0930 (小蘇)
標題 [推薦] Cellprofiler-強大的科學影像分析軟體
時間 Fri Jan  6 09:44:22 2012



軟體名稱:
CellProfiler

軟體資訊:
英文/xp~Win7/Mac/Linux

軟體功能:
科學影像分析用,可以幫你算細胞,或是某個螢光染色的強度等等

軟體特色:
可分析像是 Arrayscan 掃出來的圖,能修改的細節相當多
可搭配 CellProfiler Analyst 作一些 Data 的分析與瀏覽
(CellProfiler Analyst 也是免費)


官方網站:
http://www.cellprofiler.org/

下載連結:
CellProfiler:
http://www.cellprofiler.org/download.shtml

CellProfiler Analyst:
http://www.cellprofiler.org/downloadCPA.shtml

推薦原因:
可以批次處理一堆圖 (圖檔有命名原則就好)
重點是免費呀,同性質的付費軟體都要將近百萬上下
另外似乎可以搭配資料庫使用 (這個找時間再來研究 XD)

誰適合用:
需要科學影像分析的人

誰不適合用:
排斥英文,懶得花時間研究此軟體的人

使用感想:
只有讚而已
可以把你要的步驟 (包括影像的前處理) 全部寫在一個 pipline 裡
可針對特定的實驗寫特定的 pipline
網站上也有許多實例可以下載參考

本著作依據 Creative Commons 姓名標示-非商業性-相同方式分享 授權條款為授權

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◆ From: 140.109.235.155
ThisIsNotKFC:感覺就是個專業軟體XD1F 01/06 12:07
vixen:跟ImageJ比起來如何? 借問一下是否可轉生物版?2F 01/06 15:37
jimmy0930:CellProfiler 比較偏向 high throughput 的實驗使用3F 01/06 16:19
vixen:轉錄至看板 Biology                                        01/06 16:25
Rplus:感覺很帥氣的軟體4F 01/06 18:54

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