陸委會前副主委張顯耀爆發洩密案，政府處理手法荒腔走板，先是僅為陸委會首長層級的王郁琦處理洩密案作法，竟然是逾越職權、向張顯耀表達同意離職後願給予國營事業董事長職務，為張所拒並高調反撲後，調查局隨即配合高層欲以共諜、外患罪論之。一政府高層人士坦言，張顯耀會拒絕國營事業董座一職不願善了，根本出乎高層意料之外，不是事前沙盤推演的劇本走向，張案發展可說是完全失控，已重創兩岸互信基礎。

知情人士透露，其實早在1年多前，調查局就已接獲有關張顯耀疑似洩密的檢舉並展開調查，但因一直找不到張顯耀如何將訊息、文件洩密給中方的管道，為了追查這個可能的「中間人」，調查局遲遲無法「收網」。直到今年7月，陸委會主委王郁琦也接獲有關張案的相關檢舉，案情才露出曙光，這個「中間人」的角色才有了清楚輪廓。

就調查局的掌握，該名人士是與中國方面往來密切的民間人士，但與歐美方面並無淵源。其實張顯耀早在2012年擔任陸委會副主委前後就已往來兩岸，與對岸接觸傳遞訊息。

知情人士進一步指出，讓張顯耀離職並轉任國營事業董事長的「餿主意」，正是王郁琦向府院、國安高層提出的處理建議，就因為此一離譜主張，成為馬政府處理張案的最大敗筆，讓高層原本以為足以讓張顯耀百口莫辯的重大國安事件，淪為外界視為權力內鬥、羅織入罪的「馬王政爭」案翻版，讓張案一如去年的王柯監聽案，也陷入政治泥沼中。

高層人士坦言，王郁琦今年7月接獲指控張顯耀疑似洩密的檢舉，隨即在7月下旬與府院、國安高層多次會商並沙盤推演，最後決定依照王郁琦的建議，由王向張顯耀提出離職要求，並給予國營事業董事長一職。當時府院高層均認為，這樣的處理方式，能夠把對兩岸關係的傷害降至最低，張顯耀默默離開陸委會後就接觸不到兩岸談判等機密資料，也就無法再提前向對岸洩密相關訊息了。

高層人士進一步指出，讓府院及國安高層沒有料到的是，張顯耀的反應竟然超出高層沙盤推演的劇本內容之外，當王郁琦告知張顯耀因被檢舉洩密要他離職，但願意幫他轉任國營事業董事長時，張竟然拒絕了王郁琦的擔任國營事業董座肥缺的建議，不僅無意就範，甚至展開反擊、訴諸輿論。

後續的劇情發展，早超乎高層想像。知情人士說，此時政府高層被迫回擊，卻也因為急著下重手控損，拉高層級對張案以共諜、外患罪論之 ，結果反而因此重創了兩岸互信基礎；但實際上，就調查局及陸委會掌握的相關資料，尚未追查到張顯耀透過中間人傳遞訊息而與中方有對價關係，該名人士說，「當初真的沒有想到，這個案子會如此發展，結果演變成對兩岸關係傷害很大。」