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作者
標題 [爆卦] 英美研究2019-nCov到二月初的傳播預測
時間 Sat Jan 25 00:40:48 2020
作者
標題 [爆卦] 英美研究2019-nCov到二月初的傳播預測
時間 Sat Jan 25 00:40:48 2020
從港仔的連登討論區看到的小弟我跟流病不熟，只能幫忙翻譯，還望高手解說。
【大檸樂】初步研究指出武漢肺炎基本傳染數(R0)高過殺咗5千萬人嘅西班牙流感
- 分享自 LIHKG 討論區
https://lih.kg/eNmMLS
s
Google pdf連結如下
https://bit.ly/2vllEbp
重點
Key findings
● We estimate the basic reproductive number of the infection ( 0) to be significantly greater than one. We estimate it to be between 3.6 and 4.0, indicating that 72-75% of transmissions must be prevented by control measures for infections to stop increasing.
傳染很猛的意思。● We estimate that only 5.1% (95%CI, 4.8–5.5) of infections in Wuhan are identified, indicating a large number of infections in the community, and also reflecting the difficulty in detecting cases of this new disease. Surveillance for this novel pathogen has been launched very quickly by public health authorities in China, allowing for rapid assessment of the speed of increase of cases in Wuhan and other areas.
目前的公開數字大概只有預估感染者的5%● If no change in control or transmission happens, then we expect further outbreaks to occur in other Chinese cities, and that infections will continue to be exported to international destinations at an increasing rate. In 14 days’ time (4 February 2020), our model predicts the number of infected people in Wuhan to be greater than 250 thousand (prediction interval, 164,602 to 351,396). We predict the cities with the largest outbreaks elsewhere in China to be Shanghai, Beijing, Guangzhou, Chongqing and
Chengdu. We also predict that by 4 Feb 2020, the countries or special administrative regions at greatest risk of importing infections through air travel are Thailand, Japan, Taiwan, Hong Kong, and South Korea.
如果防疫還是這個鳥樣子，到二月初武漢會有25萬人感染，北上廣深圳通通爆發，附送泰國日韓港台灣。● Our model suggests that travel restrictions from and to Wuhan city are unlikely to be effective in halting transmission across China; with a 99% effective reduction in travel, the size of the epidemic outside of Wuhan may only be reduced by 24.9% on 4 February.
封城無用，只要有1%的人從武漢離開，到二月初也只能降低武漢外約25%的感染數。● There are important caveats to the reliability of our model predictions, based on the assumptions underpinning the model as well as the data used to fit the model. These should be considered when interpreting our findings.
以上是模型預測的，不準不要怪我。********分隔線********
畢業後好久沒有熬夜看peper，聲明如下：
1.小弟念的跟公衛沒關係，微積分也有修沒過。單純好奇研究方法加上剛好年假。
有興趣往下看的大大們姑且當作看別人的閱讀筆記，我也有附上也有找wiki找定
有興趣往下看的大大們姑且當作看別人的閱讀筆記，我也有附上也有找wiki找定
義的出處。好處是如果知道這研究怎麼出來的比較不會被嚇到，如果沒興趣的不要
罵我。歡迎專家高手學長姐指正。
2.作者也強調他的研究限制，包含現在算爆發早期很多假設還不是很確定，然後交通
資料庫沒有考慮公路鐵路、封城的控制手法、隨機效應...。不過假設也只能給他假
設，香港人都說海鮮市場被清理過了找不到源頭，死無對證。
資料庫沒有考慮公路鐵路、封城的控制手法、隨機效應...。不過假設也只能給他假
設，香港人都說海鮮市場被清理過了找不到源頭，死無對證。
3.快睡著了，後面的討論看得很費力。等我醒來再來慢慢補
********分隔線********
先看作者
第一作者： Jonathan M. Read
https://bit.ly/2TUvjjf
被引用最多的一篇200多次，2008年。看來他做感染散佈做很久了。
Dynamic social networks and the implications for the spread of infectious
disease
JM Read, KTD Eames, WJ Edmunds
Journal of The Royal SocietyInterface 5 (26), 1001-1007
這期刊在2018年IF還有3.224。
通訊作者： Chris Jewell
https://bit.ly/30Xh0Mr
被引用最多的一篇307次，2011年。
Networks and the epidemiology of infectious disease
L Danon, AP Ford, T House, CP Jewell, MJ Keeling, GO Roberts, JV Ross, ...
Interdisciplinary perspectives on infectious diseases 2011
大概是這個研究提供運算模型的。
來看內文吧。
*背景與疫情現況
2019/12/31中國官方通知WHO有疫情。
2020/1/7 定序完成
源頭未知只知道跟海鮮市場有關係
2020/1/21 WHO表示可能人傳人
2020/1/22 確診600病例，其中444人在湖北。
後續報告出有旅行史病患。 目前報告出的症狀有發熱、咳嗽、呼吸急促。重症有包含肺炎、嚴重的呼吸道症候群、腎衰竭。
武漢當地報告17死亡，主要是老人與或是慢性疾病患者。
目前的資料還不足以了解全貌。但是隨著春運增加會顯著增加病原散播。
*武漢的國內外交通狀況
市區居民一千一百萬，有高鐵與機場。2017年一月有67萬人從武漢出發，主要是去上海5.3?
*Transmission model 傳染模型
在google上找到SEIR metapopulation model是微分方程組，由具有連續時間的離散空間模?
出處https://bit.ly/37r69N8
作者用這個模型應該加上前面的資料庫來貼近目前已經在中國主要城市還有其他國外國家的
這個模型要以2020/1/21的病患數量為準。
*Epidemiological parameter estimates 傳染病學參數估計
有關transmission rate的wiki，只有英文
https://bit.ly/2RpSMrd
這個假設是一個感染病要傳播需要
1.感染者
2.容易被感染的人
3.這兩者的單位時間內的有效接觸率β=
總接觸率γ*感染風險p.
作者估計傳輸率1.07，另外發現infectious period=3.6天 (上一段有提到infectious period=
1/recovery rate，應該譯做感染期？)
感謝老天基本感染數R0 reproduction number有中文wiki
https://bit.ly/2RO8zyP
假設染病的個體在單位時間內產生出β個接觸，進而造成的新感染有著其感染期間為1/γ，所以計算基本感染數為R0=有效接觸率β/總接觸率γ 計算得R0=3.8 (95%CI, 3.6–4.0), (3.6*1.07=3.852?)
結論：這東西感染力至少不遜於SARS。*感染預報
用上面的模型他們預報透過飛航旅行造成的疾病散播狀態。這個研究有很高的假設性：沒有任何控制干預，傳染中參數不會變，旅行者的行為到其他國
家也跟假設一樣，陸運鐵運不考慮。作者估計從2020/1/21在武漢有3493人感染，而從今年一開始被感染過（應該包含康復的？）有11341人。另外也假設115個感染者在中國其他地方。估計從1/1~1/18有4764人，類似其他研究的數據。
作者的模型顯示到2/4以前的兩週內疫情持續加溫，到2/4那天有191529人新染病，總數達250370人。在上海北京廣州重慶成都會有新爆發，然後在泰國
會有相當高輸入風險 、接下來依序是日本、台灣、香港、南韓、美國、大馬、新加坡、澳洲、越南。 (這邊內文沒有提到怎麼算輸入風險，大概是他們模型內演算出來的。)
*進出武漢的旅遊限制之效力
從1/23中國官方開始封城，作者在他們的模型裡面調整外逃的市民比例從
50%~99%，只會分別降低原來預期的12.6%~24.9%。跟其他研究的結果一樣
，封城只會延緩疾病到達其他地區，而不是整體壓制散佈。然後又再強調
了一次他們只有針對空運做分析，陸運沒考慮。
50%~99%，只會分別降低原來預期的12.6%~24.9%。跟其他研究的結果一樣
，封城只會延緩疾病到達其他地區，而不是整體壓制散佈。然後又再強調
了一次他們只有針對空運做分析，陸運沒考慮。
跟SARS與MERS比較可傳遞性
這邊算的rereproductive number比其他SARS還有MERS都來得高，但是跟
其他SARS早期的研究差不多。SARS的R0是1.1~4.2，多數研究集中在2~3，隨方法而異。MERS的R0就相當低，少於1，大約是在0.5，但是會隨著衛生相關的設定而異。
*Doubling time倍增時間
SARS的倍增時間是4.6天到14.2天。作者發現，2019-nCov的倍增時間是4.1天，但是用1/1與1/21的人數，分別是24人與11257人，他們也算到另外一個數據是2.3，這個跟SARS之前在香港爆發時候的研究類似。
*Liminations研究限制
包含許多數字上的假設，只有航空公司的數據，旅遊限制的模型沒有考慮隨機效應可能造成低估。不考慮控制方面的動態變化或其他因素，也不考慮監視與報告。……Z_z
心得：
我等台灣人看了幾天笑話，幸災了幾天樂禍....
小七店員有幾個戴口罩的？
捷運手扶梯的扶手有沒有固定拿表白水嚕乾淨？
電梯按鈕有幾個上面有透明塑膠片遮著還得清潔？
百貨公司門口可以掛酒精小噴瓶的地方掛了沒？
.......
無重大八卦請勿使用此分類，否則視同濫用爆卦鬧板(文章退回、水桶6個月)
未滿30繁體中文字 水桶3個月
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→ : 快逃阿1F 114.24.94.191 台灣 01/25 00:41
推 : 慟！2F 101.12.172.160 台灣 01/25 00:42
推 : 怕3F 180.217.160.215 台灣 01/25 00:42
推 : 靠 台灣海關加油阿...4F 111.242.30.191 台灣 01/25 00:42
推 : 台商們會繼續吸奶嗎5F 27.247.42.176 台灣 01/25 00:42
推 : 看看那篇的figure 3 日本QQ6F 223.136.175.230 台灣 01/25 00:42
推 : 生化武器7F 114.32.181.107 台灣 01/25 00:42
推 : 隔壁低能國就是慘8F 110.28.13.62 台灣 01/25 00:42
→ : WHO 等沒在怕了9F 27.52.136.162 台灣 01/25 00:42
推 : 幹 可以關閉邊境嗎 禁止中國人來了10F 219.91.53.12 台灣 01/25 00:42
推 : 這傳染性比sars強11F 114.137.96.172 台灣 01/25 00:43
→ : 台灣要撐住啊…12F 180.204.38.12 台灣 01/25 00:43
→ : 趕快轉給疾管署13F 39.10.126.137 台灣 01/25 00:43
有同學在tFDA，不過不知道是不是他的業務。
噓 : 請政府即刻停止中國航線14F 27.52.63.5 台灣 01/25 00:43
推 : 這預測真的有點誇張 但也不無可能15F 180.217.102.52 台灣 01/25 00:43
多少還是有點根據，它誇大了最好，就怕它低估。
推 : 這個翻譯很可以啊16F 218.173.70.218 台灣 01/25 00:44
推 : 超過25萬人喔17F 42.77.135.127 台灣 01/25 00:44
→ : 還封什麼武漢旅遊團 快點把全中共都斷航18F 118.161.210.60 台灣 01/25 00:44
![[圖]](https://i.imgur.com/JmH3Rx5h.jpg)
推 : 能關閉中國入台了嗎 怕爆20F 111.251.178.49 台灣 01/25 00:44
推 : 一人可以傳四人21F 101.11.52.25 台灣 01/25 00:44
推 : who還在裝死 操 台灣要上緊發條了22F 114.25.177.238 台灣 01/25 00:44
推 : 東北亞+東亞+東南亞 一起GG囉23F 1.173.96.92 台灣 01/25 00:44
推 : 請蔡英文直接封閉對中航線，我不想賭！！！24F 111.83.221.34 台灣 01/25 00:45
推 : 不是說30萬人逃離武漢，大概3%...往東最26F 223.140.94.145 台灣 01/25 00:45
推 : 我們就算真的全面斷航，台灣還有金門這個問題27F 118.170.207.168 台灣 01/25 00:45
推 : 傳播幸福分享愛29F 114.137.176.3 台灣 01/25 00:45
推 : 台灣一定守不住的，年後台商開始返回30F 180.217.127.168 台灣 01/25 00:45
推 : 幹 相比對象竟然是西班牙流感 怕爆31F 180.176.163.229 台灣 01/25 00:45
推 : 幹 這看了胃痛32F 36.229.86.239 台灣 01/25 00:45
→ : 崗位出差，台灣差不多就準備等著爆發33F 180.217.127.168 台灣 01/25 00:45
推 : WHO是怕派人去 像去自殺嗎...34F 101.12.46.83 台灣 01/25 00:45
→ : 了。35F 180.217.127.168 台灣 01/25 00:45
推 : 不意外,都在上升期了,會大量增加中槍人數...36F 180.218.24.163 台灣 01/25 00:45
推 : 超級Sara,死亡率低一點換來高傳染性37F 182.158.68.227 日本 01/25 00:46
→ : 大城市就上海，上海...38F 223.140.94.145 台灣 01/25 00:46
推 : WHO:不嚴重40F 118.169.205.51 台灣 01/25 00:46
推 : 支持全面斷航 台商一律強制隔離1441F 223.141.227.191 台灣 01/25 00:46
推 : 恐怖42F 123.192.217.50 台灣 01/25 00:46
推 : 把台灣拜最後的謙虛43F 114.44.62.97 台灣 01/25 00:46
推 : 要停止擴大疫情 必須阻止75%的傳染44F 101.11.52.25 台灣 01/25 00:46
推 : 直接寄給部長信箱45F 114.27.16.4 台灣 01/25 00:46
噓 : 只有5% 所以尾數加個0還不夠啊 操46F 118.167.70.50 台灣 01/25 00:46
→ : 天47F 223.141.227.191 台灣 01/25 00:46
推 : 幹 為何要附送台灣48F 114.43.164.55 台灣 01/25 00:46
→ : biohazard49F 36.235.143.191 台灣 01/25 00:47
→ : 看是日本南韓先爆發還是台灣先而已。50F 180.217.127.168 台灣 01/25 00:47
推 : 如果為真，要守住超級難的....51F 111.71.105.214 台灣 01/25 00:47
推 : 會停班停課嗎 我比較關心這個 嘻嘻52F 115.82.21.187 台灣 01/25 00:47
推 : 幹，政府快斷航啦53F 101.13.210.238 台灣 01/25 00:47
推 : 中國城市英文是上海 北京 廣州 重慶54F 1.173.96.92 台灣 01/25 00:47
推 : 剛重看完全境擴散 R0超過3靠北可怕55F 111.246.92.195 台灣 01/25 00:47
推 : 希望台灣能守住 唉56F 223.139.94.180 台灣 01/25 00:47
→ : 成都57F 1.173.96.92 台灣 01/25 00:47
→ : 台灣要戰備狀態了 太多台商與大陸旅客58F 101.11.52.25 台灣 01/25 00:48
推 : x 這要從何防起59F 223.140.177.68 台灣 01/25 00:48
→ : 不要幻想DPP有這個種全禁台商進出中國60F 180.217.127.168 台灣 01/25 00:48
噓 : 台灣真雖小61F 111.82.231.211 台灣 01/25 00:48
→ : 好嗎？62F 180.217.127.168 台灣 01/25 00:48
噓 : 即刻停止中國人入境！ 台人返國一律隔63F 27.52.63.5 台灣 01/25 00:48
推 : 台灣遲早被中國逼成最強防疫島...64F 61.228.35.181 台灣 01/25 00:48
→ : 離兩周！ 月底關閉中國航線！65F 27.52.63.5 台灣 01/25 00:48
→ : 這波瘟疫後 是不是可以預期WHO重組幹66F 111.246.92.195 台灣 01/25 00:48
→ : 這不是開玩笑的 比sars厲害67F 101.11.52.25 台灣 01/25 00:48
推 : 我覺得守不住了 自求多福吧68F 27.52.138.10 台灣 01/25 00:49
推 : 幹69F 1.200.39.254 台灣 01/25 00:49
→ : 不如趕快找到快篩試劑，還是機場增加70F 180.217.127.168 台灣 01/25 00:50
有RT-PCR方法，德國人定序了就比較好檢測。
要再更快不知道有沒有人做出來了。
推 : 這預測模型恐怖...71F 123.192.217.50 台灣 01/25 00:50
→ : 對中國航班的X光檢疫。72F 180.217.127.168 台灣 01/25 00:50
推 : 沒事別出門 尤其人多的公共娛樂場所73F 122.116.239.198 台灣 01/25 00:50
推 : 感覺過年完就等著看中國各城市爆炸74F 118.167.70.50 台灣 01/25 00:50
→ : 可控可防 誇張了75F 111.82.131.6 台灣 01/25 00:50
推 : 台螪：沒事兒當個堂堂正正的中國人 錢76F 39.9.233.211 台灣 01/25 00:51
推 : 在對岸回台的台商就是個大漏洞啊...= =77F 180.218.24.163 台灣 01/25 00:51
→ : 真香78F 39.9.233.211 台灣 01/25 00:51
推 : 公開數字的20倍 果然很中國79F 115.82.16.59 台灣 01/25 00:52
→ : 才說要怎麼防??都拼著吃退燒藥也要回台80F 180.218.24.163 台灣 01/25 00:52
推 : 推81F 101.136.82.199 台灣 01/25 00:52
推 : 這一次真的難過了……是不是該把年後日本行程取消QQ82F 42.72.144.37 台灣 01/25 00:52
推 : 柯文哲:蔡英文白癡不懂的跟中共合作84F 61.224.199.148 台灣 01/25 00:53
推 : 過年別出門了85F 36.232.193.53 台灣 01/25 00:53
推 : 看來是免不了86F 111.241.164.198 台灣 01/25 00:53
推 : 圖3A武漢每日新增感染人數模擬，縱軸是一格五萬人是吧...87F 101.12.47.101 台灣 01/25 00:53
推 : 幹幹幹 好希望台灣鎖國89F 61.223.26.178 台灣 01/25 00:54
推 : 其他黨不要趁機被刺 dpp就敢硬起來啊90F 101.137.157.167 台灣 01/25 00:54
![[圖]](https://i.imgur.com/MvUP41x.jpg)
推 : 這篇怎麼推的人這麼少92F 220.143.26.122 台灣 01/25 00:55
→ : 為什麼還不停飛中國班機，政府在幹嘛93F 42.76.15.190 台灣 01/25 00:55
推 : 這太可怕94F 115.82.204.200 台灣 01/25 00:56
推 : 台灣也完蛋了95F 42.76.19.181 台灣 01/25 00:56
→ : 唉 可悲96F 117.19.194.128 台灣 01/25 00:56
推 : 小蔣 三不政策 快執行97F 115.82.3.85 台灣 01/25 00:57
噓 : CHO都說沒事兒，你造謠98F 223.139.231.131 台灣 01/25 00:57
推 : 這比較太恐怖了....這需要當機立斷，99F 101.12.65.227 台灣 01/25 00:57
推 : 可是我家小七店員都有戴口罩了202F 175.182.7.126 台灣 01/25 07:55
※ 編輯: purineboy (101.12.180.32 臺灣), 01/25/2020 08:13:34噓 : 高估支那狗的智商了吧203F 111.241.11.58 台灣 01/25 08:41
推 : 推204F 223.139.65.224 台灣 01/25 08:46
推 : 光看武漢這地理位置就不妙了…205F 122.121.105.90 台灣 01/25 09:23
推 : 真的是12隻猴子206F 59.126.234.96 台灣 01/25 09:54
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